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BDPA - Bases de Dados da Pesquisa Agropecuária Embrapa
 






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1.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, M. V. G. B.; LOBO, F. P.; CHUD, T.; SILVA, T. B. R.; MACHADO, M. A. A Catalog of variants in Zebu dairy cattle using next generation sequencing. In: PLANT & ANIMAL GENOME, 24., 2016, San Diego. [Proceedings...] San Diego: [s.n.], 2016.

Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.

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2.Imagem marcado/desmarcadoMOURÃO, M. de M.; BITAR, M.; LOBO, F. P.; PECONICK, A. P.; GRYNBERG, P.; PROSDOCIMI, F.; WAISBERG, M.; CERQUEIRA, G. C.; MACEDO, A. M.; MACHADO, C. R.; YOSHINO, T.; FRANCO, G. R. A directed approach for the identification of transcripts harbouring the spliced leader sequence and the effect of trans-splicing knockdown in Schistosoma mansoni. Memórias do Instituto Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, v. 108, n. 6, p. 707-717, Sept. 2013.

Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

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3.Imagem marcado/desmarcadoVELLOZO, A.; LOBO, F. P.; YAMAGISHI, M. A new BLAST-based Gbrowse plugin. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 8., 2012, Campinas. Abstract book... Ribeirão Preto: AB3C, 2012. Não paginado. X-MEETING 2012.

Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

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4.Imagem marcado/desmarcadoCARNEIRO, N.; NODA, R.; MAGALHÃES, P.; MENEZES, C.; SCHAFFERT, R.; BARROS, B.; GUIMARÃES, C.; LOBO, F. P.; ZERLOTINI, A.; MAGALHÃES, J. Association of differentially expressed genes with drought tolerant sorghum using computer analysis. In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 21.; EUROPEAN CONFERENCE ON COMPUTATIONAL BIOLOGY, 12., 2013, Berlin. Posters... Berlin: ISCB, 2013. Pôster F52.

Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Milho e Sorgo.

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5.Imagem marcado/desmarcadoYAMAGISHI, M. E. B.; LOBO, F. P.; VELLOZO, A. F. Blast.pm. Versão 0.01. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2012. 1 CD-ROM.

Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

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6.Imagem marcado/desmarcadoCASTRO, G. M. de; LOBO, F. P. Busca computacional por grupos de genes homólogos sob evidência de seleção positiva em Alphaherpesvirinae. In: MOSTRA DE ESTAGIÁRIOS E BOLSISTAS DA EMBRAPA INFORMÁTICA AGROPECUÁRIA, 8., 2012, Campinas. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2012. p. 167-170.

Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

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7.Imagem marcado/desmarcadoCARRIERO, M. M.; HENRIQUE-SILVA, F.; CAETANO, A. R.; LOBO, F. P.; ALVES, A. L.; VARELA, E. S.; COLLADO, M. del; MOREIRA, G. S. A.; MAIA, A. A. M. Characterization and gene expression analysis of pacu (Piaractus mesopotamicus) inducible nitric oxide synthase (iNOS) following Aeromonas dhakensis infection. Fish and Shellfish Immunology, v. 74, p. 94-100, 2018. Short communication.

Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pesca e Aquicultura; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.

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8.Imagem marcado/desmarcadoGERHARDT, I. R.; GIACHETTO, P. F.; YAMAGISHI, M. E. B.; LOBO, F. P.; TEIXEIRA, J.; PENCHEL, R. M.; MISSIAGGIA, A. Comparative transcriptome analysis of eucalyptus genotypes that differ in carbon allocation. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOME, 20., 2012, San Diego. Abstract... Jersey City: Scherago International, 2012. Não paginado. 1 pôster.

Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Florestas.

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9.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, F. R. da; NODA, R. W.; ZERLOTINI, A.; LOBO, F. P.; CARNEIRO, N. P. Counting RNAseq reads: which way is better? In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 21.; EUROPEAN CONFERENCE ON COMPUTATIONAL BIOLOGY, 12., 2013, Berlin. Posters... Berlin: ISCB, 2013. Não paginado. Pôster N101.

Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Milho e Sorgo.

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10.Imagem marcado/desmarcadoRODRIGUES, F. A.; FUGANTI-PAGLIARINI, R.; MARCOLINO-GOMES, J.; NAKAYAMA, T. J.; MOLINARI, H. B. C.; LOBO, F. P.; HARMON, F. G.; NEPAMUCENO, A. L. Daytime soybean transcriptome fluctuations during water deficit stress. BMC Genomics, v. 16, n. 505, p. 2-19, 2015.

Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia.

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11.Imagem marcado/desmarcadoRODRIGUES, F. A.; FUGANTI-PAGLIARINI, R.; MARCOLINO-GOMES, J.; NAKAYAMA, T. J.; MOLINARI, H. B. C.; LOBO, F. P.; HARMON, F. G.; NEPOMUCENO, A. L. Daytime soybean transcriptome fluctuations during water deficit stress. BMC Genomics, v. 16, n. 505, 2015. 19 p.

Biblioteca(s): Embrapa Soja.

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12.Imagem marcado/desmarcadoCINTRA, L. C.; ZERLOTINI, A.; LOBO, F. P.; SILVA, F. R. da; GIACHETTO, P. F.; KUSER-FALCÃO, P. R. K.; SILVA, L. O. C. da; EGITO, A. A. do; SIQUEIRA, F.; SILVA, N. M. A. da; PAIVA, S. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; CAETANO, A. R. De novo assembly of a Nelore (Bos indicus) bull genome based on short read sequences. In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 22., 2014, San Diego, CA. [Abstracts]. San Diego: [s.n.], 2014. Não paginado. P554.

Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.

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13.Imagem marcado/desmarcadoCINTRA, L. C.; ZERLOTINI, A.; LOBO, F. P.; SILVA, F. R. da; GIACHETTO, P. F.; KUSER-FALCÃO, P. R. K.; SILVA, L. O. C. da; EGITO, A. A. do; SIQUEIRA, F.; SILVA, N. M. A. da; PAIVA, S. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; CAETANO, A. R. De novo assembly of a Nelore (Bos indicus) bull genome based on short read sequences. In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 22., 2014, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s.n.], 2014. Não paginado. P554.

Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

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14.Imagem marcado/desmarcadoLOBO, F. P.; CINTRA, L. C.; VARELA, E. S.; ALVES, A. L.; VILLELA, L. C. V.; SILVA, N. M. A. da; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R. de novo genome assembly of the South American freshwater fish Tambaqui (Colossoma macropomum). In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 23., 2015, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s.n.], 2015. não paginado. Pôster P0231.

Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura.

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15.Imagem marcado/desmarcadoLOBO, F. P.; CINTRA, L. C.; VARELA, E. S.; ALVES, A. L.; VILLELA, L. C. V.; SILVA, N. M. A. da; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R. de novo genome assembly of the South American freshwater fish Tambaqui (Colossoma macropomum). In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 23., 2015, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s.n.], 2015. não paginado. PAG 2015. Pôster P0231.

Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

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16.Imagem marcado/desmarcadoCAETANO, A. R.; ALVES, A. L.; VARELA, E. S.; VILLELA, L. C. V.; SILVA, N. M. A. da; LOBO, F. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; GIACHETTO, P. F.; HIGA, R. H.; PAIVA, S. R. Desenvolvimento de ferramentas genômicas para manejo e melhoramento genético de peixes nativos do Brasil. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 3., 2014, Santos. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2014.

Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura.

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17.Imagem marcado/desmarcadoCAETANO, A. R.; ALVES, A. L.; VARELA, E. S.; VILLELA, L. C. V.; SILVA, N. M. A. da; LOBO, F. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; GIACHETTO, P. F.; HIGA, R. H.; PAIVA, S. R. Desenvolvimento de ferramentas genômicas para manejo e melhoramento genético de peixes nativos do Brasil. In. CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 3., 2014, Santos. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2014. Resumo. 367. 1 CD-ROM.

Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.

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18.Imagem marcado/desmarcadoHONGO, J. A.; LOBO, F. P. Desenvolvimento de software para a detecção de grupos de genes homólogos sob evidência de seleção positiva. In: MOSTRA DE ESTAGIÁRIOS E BOLSISTAS DA EMBRAPA INFORMÁTICA AGROPECUÁRIA, 7., 2011, Campinas. Resumos... Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2011. p. 28-31.

Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

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19.Imagem marcado/desmarcadoAGUIRRE, A. de A. R.; LOBO, F. P.; ANDREOTTI, R. Design of the ATAQ peptide and its evaluation as an immunogen to develop a Rhipicephalus vaccine. Veterinary Parasitology, v. 221, p. 30-38, 2016

Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte.

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20.Imagem marcado/desmarcadoHONGO, J. A.; ZERLOTINI NETO, A.; LOBO, F. P. Detecção e análise bioinformática de genes sob evidência de seleção positiva em genomas de parasitos. In: CONGRESSO INTERINSTITUCIONAL DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 6., 2012, Jaguariúna. Anais... Jaguariúna: Embrapa; ITAL, 2012. p. 1-10. CIIC 2012. No 12612.

Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

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1.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, M. V. G. B.; LOBO, F. P.; CHUD, T.; SILVA, T. B. R.; MACHADO, M. A. A Catalog of variants in Zebu dairy cattle using next generation sequencing. In: PLANT & ANIMAL GENOME, 24., 2016, San Diego. [Proceedings...] San Diego: [s.n.], 2016.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.
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2.Imagem marcado/desmarcadoMOURÃO, M. de M.; BITAR, M.; LOBO, F. P.; PECONICK, A. P.; GRYNBERG, P.; PROSDOCIMI, F.; WAISBERG, M.; CERQUEIRA, G. C.; MACEDO, A. M.; MACHADO, C. R.; YOSHINO, T.; FRANCO, G. R. A directed approach for the identification of transcripts harbouring the spliced leader sequence and the effect of trans-splicing knockdown in Schistosoma mansoni. Memórias do Instituto Oswaldo Cruz, Rio de Janeiro, v. 108, n. 6, p. 707-717, Sept. 2013.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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3.Imagem marcado/desmarcadoVELLOZO, A.; LOBO, F. P.; YAMAGISHI, M. A new BLAST-based Gbrowse plugin. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 8., 2012, Campinas. Abstract book... Ribeirão Preto: AB3C, 2012. Não paginado. X-MEETING 2012.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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4.Imagem marcado/desmarcadoCARNEIRO, N.; NODA, R.; MAGALHÃES, P.; MENEZES, C.; SCHAFFERT, R.; BARROS, B.; GUIMARÃES, C.; LOBO, F. P.; ZERLOTINI, A.; MAGALHÃES, J. Association of differentially expressed genes with drought tolerant sorghum using computer analysis. In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 21.; EUROPEAN CONFERENCE ON COMPUTATIONAL BIOLOGY, 12., 2013, Berlin. Posters... Berlin: ISCB, 2013. Pôster F52.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Milho e Sorgo.
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5.Imagem marcado/desmarcadoYAMAGISHI, M. E. B.; LOBO, F. P.; VELLOZO, A. F. Blast.pm. Versão 0.01. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2012. 1 CD-ROM.
Tipo: Software
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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6.Imagem marcado/desmarcadoCASTRO, G. M. de; LOBO, F. P. Busca computacional por grupos de genes homólogos sob evidência de seleção positiva em Alphaherpesvirinae. In: MOSTRA DE ESTAGIÁRIOS E BOLSISTAS DA EMBRAPA INFORMÁTICA AGROPECUÁRIA, 8., 2012, Campinas. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2012. p. 167-170.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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7.Imagem marcado/desmarcadoCARRIERO, M. M.; HENRIQUE-SILVA, F.; CAETANO, A. R.; LOBO, F. P.; ALVES, A. L.; VARELA, E. S.; COLLADO, M. del; MOREIRA, G. S. A.; MAIA, A. A. M. Characterization and gene expression analysis of pacu (Piaractus mesopotamicus) inducible nitric oxide synthase (iNOS) following Aeromonas dhakensis infection. Fish and Shellfish Immunology, v. 74, p. 94-100, 2018. Short communication.
Tipo: Nota Técnica/Nota CientíficaCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pesca e Aquicultura; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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8.Imagem marcado/desmarcadoGERHARDT, I. R.; GIACHETTO, P. F.; YAMAGISHI, M. E. B.; LOBO, F. P.; TEIXEIRA, J.; PENCHEL, R. M.; MISSIAGGIA, A. Comparative transcriptome analysis of eucalyptus genotypes that differ in carbon allocation. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOME, 20., 2012, San Diego. Abstract... Jersey City: Scherago International, 2012. Não paginado. 1 pôster.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Florestas.
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9.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, F. R. da; NODA, R. W.; ZERLOTINI, A.; LOBO, F. P.; CARNEIRO, N. P. Counting RNAseq reads: which way is better? In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 21.; EUROPEAN CONFERENCE ON COMPUTATIONAL BIOLOGY, 12., 2013, Berlin. Posters... Berlin: ISCB, 2013. Não paginado. Pôster N101.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Milho e Sorgo.
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10.Imagem marcado/desmarcadoRODRIGUES, F. A.; FUGANTI-PAGLIARINI, R.; MARCOLINO-GOMES, J.; NAKAYAMA, T. J.; MOLINARI, H. B. C.; LOBO, F. P.; HARMON, F. G.; NEPAMUCENO, A. L. Daytime soybean transcriptome fluctuations during water deficit stress. BMC Genomics, v. 16, n. 505, p. 2-19, 2015.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia.
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11.Imagem marcado/desmarcadoRODRIGUES, F. A.; FUGANTI-PAGLIARINI, R.; MARCOLINO-GOMES, J.; NAKAYAMA, T. J.; MOLINARI, H. B. C.; LOBO, F. P.; HARMON, F. G.; NEPOMUCENO, A. L. Daytime soybean transcriptome fluctuations during water deficit stress. BMC Genomics, v. 16, n. 505, 2015. 19 p.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Soja.
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12.Imagem marcado/desmarcadoCINTRA, L. C.; ZERLOTINI, A.; LOBO, F. P.; SILVA, F. R. da; GIACHETTO, P. F.; KUSER-FALCÃO, P. R. K.; SILVA, L. O. C. da; EGITO, A. A. do; SIQUEIRA, F.; SILVA, N. M. A. da; PAIVA, S. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; CAETANO, A. R. De novo assembly of a Nelore (Bos indicus) bull genome based on short read sequences. In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 22., 2014, San Diego, CA. [Abstracts]. San Diego: [s.n.], 2014. Não paginado. P554.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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13.Imagem marcado/desmarcadoCINTRA, L. C.; ZERLOTINI, A.; LOBO, F. P.; SILVA, F. R. da; GIACHETTO, P. F.; KUSER-FALCÃO, P. R. K.; SILVA, L. O. C. da; EGITO, A. A. do; SIQUEIRA, F.; SILVA, N. M. A. da; PAIVA, S. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; CAETANO, A. R. De novo assembly of a Nelore (Bos indicus) bull genome based on short read sequences. In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 22., 2014, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s.n.], 2014. Não paginado. P554.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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14.Imagem marcado/desmarcadoLOBO, F. P.; CINTRA, L. C.; VARELA, E. S.; ALVES, A. L.; VILLELA, L. C. V.; SILVA, N. M. A. da; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R. de novo genome assembly of the South American freshwater fish Tambaqui (Colossoma macropomum). In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 23., 2015, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s.n.], 2015. não paginado. Pôster P0231.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura.
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15.Imagem marcado/desmarcadoLOBO, F. P.; CINTRA, L. C.; VARELA, E. S.; ALVES, A. L.; VILLELA, L. C. V.; SILVA, N. M. A. da; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R. de novo genome assembly of the South American freshwater fish Tambaqui (Colossoma macropomum). In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 23., 2015, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s.n.], 2015. não paginado. PAG 2015. Pôster P0231.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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16.Imagem marcado/desmarcadoCAETANO, A. R.; ALVES, A. L.; VARELA, E. S.; VILLELA, L. C. V.; SILVA, N. M. A. da; LOBO, F. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; GIACHETTO, P. F.; HIGA, R. H.; PAIVA, S. R. Desenvolvimento de ferramentas genômicas para manejo e melhoramento genético de peixes nativos do Brasil. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 3., 2014, Santos. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2014.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura.
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17.Imagem marcado/desmarcadoCAETANO, A. R.; ALVES, A. L.; VARELA, E. S.; VILLELA, L. C. V.; SILVA, N. M. A. da; LOBO, F. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; GIACHETTO, P. F.; HIGA, R. H.; PAIVA, S. R. Desenvolvimento de ferramentas genômicas para manejo e melhoramento genético de peixes nativos do Brasil. In. CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 3., 2014, Santos. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2014. Resumo. 367. 1 CD-ROM.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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18.Imagem marcado/desmarcadoHONGO, J. A.; LOBO, F. P. Desenvolvimento de software para a detecção de grupos de genes homólogos sob evidência de seleção positiva. In: MOSTRA DE ESTAGIÁRIOS E BOLSISTAS DA EMBRAPA INFORMÁTICA AGROPECUÁRIA, 7., 2011, Campinas. Resumos... Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2011. p. 28-31.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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19.Imagem marcado/desmarcadoAGUIRRE, A. de A. R.; LOBO, F. P.; ANDREOTTI, R. Design of the ATAQ peptide and its evaluation as an immunogen to develop a Rhipicephalus vaccine. Veterinary Parasitology, v. 221, p. 30-38, 2016
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
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20.Imagem marcado/desmarcadoHONGO, J. A.; ZERLOTINI NETO, A.; LOBO, F. P. Detecção e análise bioinformática de genes sob evidência de seleção positiva em genomas de parasitos. In: CONGRESSO INTERINSTITUCIONAL DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 6., 2012, Jaguariúna. Anais... Jaguariúna: Embrapa; ITAL, 2012. p. 1-10. CIIC 2012. No 12612.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
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